Lepki koniec

Z Wikipedii

Lepki koniec - składający się z kilku nukleotydów jednoniciowy odcinek na końcu dwuniciowej cząsteczki DNA.

Lepkie końce mogą powstawać przez przecięcie dwuniciowej cząsteczki DNA enzymem restrykcyjnym. Przykładowo enzym restrykcyjny EcoRI rozpoznaje sekwencję 5'-GAATTC-3' w dwuniciowym DNA:

5' G|A A T T C 3'   
3' C T T A A|G 5'   

i niesymetrycznie przecina dwuniciową cząsteczkę, w taki sposób, że na nowo powstałych końcach znajdują się jednoniciowe fragmenty o długości 4 nukleotydów.

5' G                A A T T C 3'   
3' C T T A A                G 5' 

Niektóre enzymy restrykcyjne rozpoznają inną sekwencję, ale zostawiają takie same lepkie końce, np NotI rozpoznaje 8-nukleotydową sekwencję 5'-GC|GGCCGC-3', a EagI 6-nukleotydową sekwencję 5'-C|GGCCG-3'.

Istnieją też enzymy przecinające dwuniciową cząsteczkę DNA symetrycznie i pozostawiające tzw. tępe końce, np. EcoRV albo SmaI. Sekwencja rozpoznawana przez enzym SmaI:

5' G G G|C C C 3'   
3' C C C|G G G 5'  

jest przez ten enzym przecinana w następujący sposób:

5' G G G              C C C 3'   
3' C C C              G G G 5'  

Cząsteczki DNA zakończone komplementarnymi lepkimi końcami można połączyć za pomocą enzymu ligazy. Również cząsteczki z tępymi końcami można łączyć ze sobą za pomocą ligazy.