Pożywka SOC
Z Wikipedii
Pożywka SOC (z ang. Super Optimal Catabolite repression[1], dosł. SuperOptymalna represja Kataboliczna[2]) - kompletna, bogata pożywka do mikrobiologicznej hodowli bakterii, w szczególności do efektywnej hodowli bakterii E. coli poddanych transformacji plazmidowej - do lepszego podtrzymania ich po tym procesie, co wpływa dodatnio na jego efektywność[3].
Po raz pierwszy zbadana i opisana w 1983 w pracy D. Hanahana, podczas jego studiów nad transformacją bakterii plazmidami[4].
Pożywka SOB (z ang. Super Optimal Broth[1], Pożywka (Bulion) SuperOptymalny), także jest używana w celu lepszego podtrzymania kultur bakteryjnych po transformacji, jest pierwotną wersją pożywki SOC. Pożywka SOC jednak, w przeciwieństwie do SOB, zawiera dodatkowo glukozę, która jest katabolicznym represorem plazdmiów z promotorem laktozowym - używanych w transformacjach bakterii.
Pożywki SOC i SOB zawierają rozpuszczone w wodzie bidestylowanej: ekstrakt (lizat) z drożdży, trypton oraz NaCl i KCl. Pożywki takie zawierają w ten sposób wszystkie niezbędne do wzrostu aminokwasy, czyli źródło azotu (z tryptonu i lizatu), a także witaminy i mikroelementy (z lizatu drożdżowego). Sól (NaCl) zapewnia odpowiednią osmotyczność środowiska i jony sodu niezbędne do transportu błonowego, a jony potasowe z KCl pomagają szybko przywrócić równowagę osmotyczną oraz zależne od niej procesy oparte na tym jonie, zwykle mocno wytrącone z równowagi w procesie transformacji. Gotowe pożywki mają żółtawo-słomkową barwę i są przezroczyste.
[edytuj] Skład
[edytuj] SOC[5]
- 2% (w/o) trypton
- 0,5% (w/o) ekstrakt drożdżowy
- 0,05% (w/o) NaCl
- 2,5 mM KCl
- 20 mM sterylnej glukozy
- w wodzie bidestylowanej
Pożywkę SOC sterylizuje się przed dodaniem glukozy, żeby uniknąć ich rozkładu podczas ogrzewania z aminokwasami (lub peptydami) na drodze reakcji Maillarda.
[edytuj] SOB[6]
- 2% (w/o) trypton
- 0,5% (w/o) ekstrakt drożdżowy
- 0,05% (w/o) NaCl
- 2,5 mM KCl
- w wodzie bidestylowanej
By osiągnąć odpowiednie, lekko zasadowe pH pomiędzy 7,5, a 8, dodaje się do pożywki SOC i SOB wodorotlenek sodu.
Przypisy
- ↑ 1,0 1,1 SOC medium - acronym pedantry! (en). protocol-online.org, 25-10-2005. [dostęp 1-12-2007].
- ↑ Dokładnie wg kontekstu "Pożywka superoptymalna z represją kataboliczną"
- ↑ Joseph Sambrook, David W. Russell: Molecular Cloning. Cold Spring Harbor, NY, USA: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001.
- ↑ Hanhan. D. Studies on transformation of Escherichia coli with plasmids. J Mol Biol., 166, 557-580. 1983. PMID 6345791.
- ↑ SOC - Receptura z zasobów changbioscience.com (en)
- ↑ SOB - Receptura z zasobów changbioscience.com (en)
