Uliniowianie
Z Wikipedii
 |
Ten artykuł wymaga uzupełnienia źródeł podanych informacji. Aby uczynić go weryfikowalnym, należy podać przypisy do materiałów opublikowanych w wiarygodnych źródłach. |
 |
Niektóre informacje zawarte w artykule wymagają weryfikacji. Do weryfikacji: uliniawianie, uliniowianie? |
W bioinformatyce, uliniawianie sekwencji to sposób porównywania sekwencji pierwszorzędowej DNA, RNA bądź białek w celu identyfikacji regionów podobnych, które mogą być wynikiem funkcjonalnych, strukturalnych bądź ewolucyjnych związków pomiędzy sekwencjami. Uliniowione sekwencje rezyduów nukleotydów bądź aminokwasów zwykle są przedstawiane jako wiersze macierzy Pomiędzy znaki wstawiane są przerwy w taki sposób, aby zapewnić jak największą zgodność porównywanych sekwencji. Jeśli dwie uliniawiane sekwencje pochodzą od wspólnego przodka niezgodności mogą być interpretowane jako mutacje punktowe, natomiast przerwy jako mutacje insercji bądź delecji w jednej z sekwencji, natomiast poziom podobieństwa sekwencji świadczy o tym, jak bardzo konserwatywne są porównywane sekwencje bądź domeny. Małe zmiany w danym rejonie mogą świadczyć o wysokiej wadze danej domeny dla zachowania funkcji białka (Mogą to być również zmiany aminokwasów na inne o podobnych właściwościach biochemicznych. Uliniawianie sekwencji może być używane również poza biologią in silico, jak np. poszukiwanie podobieństw w ciągach liter i słów w różnych językach.
