Proteasome-associated HECT-type ubiquitin ligase activity is required for plant immunity

by James J. Furniss, Heather Grey, Zhishuo Wang, Mika Nomoto, Lorna Jackson, Yasuomi Tada, Steven H. Spoel

Regulated degradation of proteins by the 26S proteasome plays important roles in maintenance and signalling in eukaryotic cells. Proteins are marked for degradation by the action of E3 ligases that site-specifically modify their substrates by adding chains of ubiquitin. Innate immune signalling in plants is deeply reliant on the ubiquitin-26S proteasome system. While progress has (altro…)

Population sequencing reveals clonal diversity and ancestral inbreeding in the grapevine cultivar Chardonnay

by Michael J. Roach, Daniel L. Johnson, Joerg Bohlmann, Hennie J. J. van Vuuren, Steven J. M. Jones, Isak S. Pretorius, Simon A. Schmidt, Anthony R. Borneman

Chardonnay is the basis of some of the world’s most iconic wines and its success is underpinned by a historic program of clonal selection. There are numerous clones of Chardonnay available that exhibit differences in key viticultural and oenological traits that have arisen from the (altro…)

Modulation of <i>Drosophila</i> post-feeding physiology and behavior by the neuropeptide leucokinin

by Meet Zandawala, Maria E. Yurgel, Michael J. Texada, Sifang Liao, Kim F. Rewitz, Alex C. Keene, Dick R. Nässel

Behavior and physiology are orchestrated by neuropeptides acting as central neuromodulators and circulating hormones. An outstanding question is how these neuropeptides function to coordinate complex and competing behaviors. In Drosophila, the neuropeptide leucokinin (LK) modulates diverse functions, but mechanisms underlying these complex interactions remain poorly understood. As a first step towards understanding (altro…)

Evidence for gene-environment correlation in child feeding: Links between common genetic variation for BMI in children and parental feeding practices

by Saskia Selzam, Tom A. McAdams, Jonathan R. I. Coleman, Susan Carnell, Paul F. O’Reilly, Robert Plomin, Clare H. Llewellyn

The parental feeding practices (PFPs) of excessive restriction of food intake (‘restriction’) and pressure to increase food consumption (‘pressure’) have been argued to causally influence child weight in opposite directions (high restriction causing overweight; high pressure causing underweight). However child weight could also ‘elicit’ PFPs. A novel approach is to investigate gene-environment (altro…)

Loss of the Mia40a oxidoreductase leads to hepato-pancreatic insufficiency in zebrafish

by Anna M. Sokol, Barbara Uszczynska-Ratajczak, Michelle M. Collins, Michal Bazala, Ulrike Topf, Pia R. Lundegaard, Sreedevi Sugunan, Stefan Guenther, Carsten Kuenne, Johannes Graumann, Sherine S. L. Chan, Didier Y. R. Stainier, Agnieszka Chacinska

Development and function of tissues and organs are powered by the activity of mitochondria. In humans, inherited genetic mutations that lead to progressive mitochondrial pathology often manifest during infancy and can lead to death, reflecting the indispensable nature (altro…)

Deepbinner: Demultiplexing barcoded Oxford Nanopore reads with deep convolutional neural networks

by Ryan R. Wick, Louise M. Judd, Kathryn E. Holt

Multiplexing, the simultaneous sequencing of multiple barcoded DNA samples on a single flow cell, has made Oxford Nanopore sequencing cost-effective for small genomes. However, it depends on the ability to sort the resulting sequencing reads by barcode, and current demultiplexing tools fail to classify many reads. Here we present Deepbinner, a tool for Oxford Nanopore demultiplexing that uses a deep neural network (altro…)

Adaptive feature detection from differential processing in parallel retinal pathways

by Yusuf Ozuysal, David B. Kastner, Stephen A. Baccus

To transmit information efficiently in a changing environment, the retina adapts to visual contrast by adjusting its gain, latency and mean response. Additionally, the temporal frequency selectivity, or bandwidth changes to encode the absolute intensity when the stimulus environment is noisy, and intensity differences when noise is low. We show that the On pathway of On-Off retinal amacrine and ganglion cells is required (altro…)

Reducing chronic disease through changes in food aid: A microsimulation of nutrition and cardiometabolic disease among Palestinian refugees in the Middle East

by Sanjay Basu, John S. Yudkin, Seth A. Berkowitz, Mohammed Jawad, Christopher Millett

Background

Type 2 diabetes mellitus and cardiovascular disease and have become leading causes of morbidity and mortality among Palestinian refugees in the Middle East, many of whom live in long-term settlements and receive grain-based food aid. The objective of this study was to estimate changes in type 2 diabetes and cardiovascular disease morbidity and mortality attributable to a transition (altro…)

Healthy volunteers’ perceptions of risk in US Phase I clinical trials: A mixed-methods study

by Jill A. Fisher, Lisa McManus, Marci D. Cottingham, Julianne M. Kalbaugh, Megan M. Wood, Torin Monahan, Rebecca L. Walker

Background

There is limited research on healthy volunteers’ perceptions of the risks of Phase I clinical trials. In order to contribute empirically to long-standing ethical concerns about healthy volunteers’ involvement in drug development, it is crucial to assess how these participants understand trial risks. The objectives of this study were to investigate (altro…)

Automated detection of moderate and large pneumothorax on frontal chest X-rays using deep convolutional neural networks: A retrospective study

by Andrew G. Taylor, Clinton Mielke, John Mongan

Background

Pneumothorax can precipitate a life-threatening emergency due to lung collapse and respiratory or circulatory distress. Pneumothorax is typically detected on chest X-ray; however, treatment is reliant on timely review of radiographs. Since current imaging volumes may result in long worklists of radiographs awaiting review, an automated method of prioritizing X-rays with pneumothorax may reduce time to treatment. Our objective was to create a (altro…)

The use of machine learning to understand the relationship between IgE to specific allergens and asthma

by Thomas A. E. Platts-Mills, Matthew Perzanowski

Thomas Platts-Mills and Matthew Perzanowski provide their expert Perspective on a translational study from Custovic and colleagues that identifies pairings of IgE that show value in estimating risk of concurrent asthma.

Tratto da: www.plos.org
Note sul Copyright: Articles and accompanying materials published by PLOS on the PLOS Sites, unless otherwise indicated, are licensed by the respective authors of such articles for use and distribution by you subject (altro…)

Predicting the risk of emergency admission with machine learning: Development and validation using linked electronic health records

by Fatemeh Rahimian, Gholamreza Salimi-Khorshidi, Amir H. Payberah, Jenny Tran, Roberto Ayala Solares, Francesca Raimondi, Milad Nazarzadeh, Dexter Canoy, Kazem Rahimi

Background

Emergency admissions are a major source of healthcare spending. We aimed to derive, validate, and compare conventional and machine learning models for prediction of the first emergency admission. Machine learning methods are capable of capturing complex interactions that are likely to be present when predicting less specific outcomes, such as (altro…)

Deep learning for chest radiograph diagnosis: A retrospective comparison of the CheXNeXt algorithm to practicing radiologists

by Pranav Rajpurkar, Jeremy Irvin, Robyn L. Ball, Kaylie Zhu, Brandon Yang, Hershel Mehta, Tony Duan, Daisy Ding, Aarti Bagul, Curtis P. Langlotz, Bhavik N. Patel, Kristen W. Yeom, Katie Shpanskaya, Francis G. Blankenberg, Jayne Seekins, Timothy J. Amrhein, David A. Mong, Safwan S. Halabi, Evan J. Zucker, Andrew Y. Ng, Matthew P. Lungren

Background

Chest radiograph interpretation is critical for the detection of thoracic diseases, including tuberculosis and lung cancer, which (altro…)

Evolution of correlated complexity in the radically different courtship signals of birds-of-paradise

by Russell A. Ligon, Christopher D. Diaz, Janelle L. Morano, Jolyon Troscianko, Martin Stevens, Annalyse Moskeland, Timothy G. Laman, Edwin Scholes III

Ornaments used in courtship often vary wildly among species, reflecting the evolutionary interplay between mate preference functions and the constraints imposed by natural selection. Consequently, understanding the evolutionary dynamics responsible for ornament diversification has been a longstanding challenge in evolutionary biology. However, comparing radically different ornaments across species, as well (altro…)

Reproducible research practices, transparency, and open access data in the biomedical literature, 2015–2017

by Joshua D. Wallach, Kevin W. Boyack, John P. A. Ioannidis

Currently, there is a growing interest in ensuring the transparency and reproducibility of the published scientific literature. According to a previous evaluation of 441 biomedical journals articles published in 2000–2014, the biomedical literature largely lacked transparency in important dimensions. Here, we surveyed a random sample of 149 biomedical articles published between 2015 and 2017 and determined the proportion reporting sources of (altro…)

Invasione cimice marmorata asiatica: audizioni informali in 9a Commissione

Martedì 20 11 2018

La Commissione Agricoltura, mercoledì 21 novembre alle 15,15, ha in programma l’audizione di rappresentanti del Consiglio per la ricerca in agricoltura e l’analisi dell’economia agraria (CREA) sull’affare assegnato n. 101, invasione della cimice marmorata asiatica (Halyomorpha halys), in sede di Ufficio di Presidenza.

Tratto da www.senato.it

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O.D.G. Giunte e Commissioni: Giunta delle elezioni e delle immunita’ parlamentari – 27/11/2018

O.D.G. Giunte e Commissioni

Giunta delle elezioni e delle immunita’ parlamentari

Seduta/e: 11 del 27/11/2018

odg-giuntaelezionieimmunita-27112018.pdf


Tratto da www.senato.it

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Decreto sicurezza, inizio esame per il parere

La II Commissione Giustizia, in sede consultiva, ha iniziato l’esame del disegno di legge C. 1346 Governo, approvato dal Senato, di conversione in legge, con modificazioni, del decreto-legge n. 113 del 2018, recante Disposizioni urgenti in materia di protezione internazionale e immigrazione, sicurezza pubblica, nonché misure per la funzionalità del Ministero dell’interno e l’organizzazione e il funzionamento dell’Agenzia nazionale per l’amministrazione e la destinazione dei beni sequestrati e confiscati alla criminalità (altro…)

Martedì 20 Novembre 2018 – 60ª Seduta pubblica : Comunicato di seduta

Seduta
Ora inizio: 16:35

Non essendo stato concluso l’esame in sede referente del decreto fiscale e della legge europea, l’Assemblea è passata alla ratifica di accordi internazionali.

Tratto da www.senato.it

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Cnr 95 anni di futuro – Cerimonia domani a Roma – Partecipa Carfagna

Domani, mercoledì 21 novembre, la Vicepresidente della Camera, Mara Carfagna, è presso la sede del Centro nazionale delle ricerche di Roma per la cerimonia “Cnr 95 anni di futuro”. Partecipa il Capo dello Stato, Sergio Mattarella.

Tratto da: www.camera.it
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Presidente Alberti Casellati a Londra. Al centro dei colloqui Brexit e diritti dei cittadini italiani residenti nel Regno Unito

Martedì 20 11 2018

La visita a Londra del Presidente Casellati è la prima di un Presidente del Senato italiano dal 2013.
Londra è uno degli ecosistemi più vibranti per l’innovazione e le start-up, favorita dalla presenza di un triangolo di eccellenza (Londra-Cambridge-Oxford) di istituzioni accademiche. L’Italia ne è parte con una capillare – e molto apprezzata – presenza di accademici, scienziati, ricercatori, studenti italiani in tutte le principali istituzioni britanniche.
Questi nostri (altro…)

Presidente Alberti Casellati a Londra: il saluto dello Speaker durante la seduta della Camera dei Comuni 

Martedì 20 11 2018

Dopo l’incontro con il Presidente del Senato Elisabetta Alberti Casellati, lo Speaker della Camera dei Comuni John Bercow nel presiedere l’assemblea ne ha poi interrotto brevemente i lavori per rivolgere un saluto particolare alla senatrice Elisabetta Alberti Casellati, che ha ricordato essere la prima donna eletta Presidente del Senato italiano. L’assemblea della Camera dei Comuni ha salutato queste parole del suo Speaker con un prolungato applauso.

Tratto da (altro…)

Commissione Agricoltura, audizioni su riforma politica agricola comune (Pac) – Mercoledì alle 15 diretta webtv

Mercoledì 21 novembre, alle ore 15, la Commissione Agricoltura svolge l’audizione di rappresentanti della Coalizione #CambiamoAgricoltura (Aiab, Associazione per l’agricoltura biodinamica, Fai, Federbio, Legambiente, Lipu, Più natura e Wwf), nell’ambito dell’esame delle proposte di regolamento del Parlamento europeo e del Consiglio di riforma della politica agricola comune (Pac) per il periodo 2021-2027.
L’appuntamento viene trasmesso in diretta webtv.

Tratto da: www.camera.it
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Comitato per la legislazione, audizione Vice Capo Dipartimento Affari giuridici e legislativi della Presidenza del Consiglio – Mercoledì alle 15 diretta webtv

Mercoledì 21 novembre alle ore 15, presso l’Aula della Commissione Bilancio, il Comitato per la legislazione, ai sensi dell’articolo 143, comma 2, del Regolamento, svolge l’audizione dell’avv. Stefano Varone, Vice Capo del Dipartimento per gli Affari giuridici e legislativi della Presidenza del Consiglio dei Ministri sulle attuali tendenze della produzione normativa.>br /> L’appuntamento viene trasmesso in diretta webtv.

Tratto da: www.camera.it
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Audizioni su cure palliative e alla terapia del dolore – Mercoledì dalle 14,35 diretta webtv

Mercoledì 21 novembre, la Commissione Affari sociali, in merito all’indagine conoscitiva sull’attuazione della legge 15 marzo 2010, n. 38, in materia di accesso alle cure palliative e alla terapia del dolore, con particolare riferimento all’ambito pediatrico, svolge le seguenti audizioni:
ore 14.35 Gianlorenzo Scaccabarozzi, direttore della Rete cure palliative di Lecco e già presidente della Sezione cure palliative-terapie del dolore del Comitato tecnico sanitario del Ministero della salute;
ore 14.55 Federazione nazionale degli (altro…)

Commissione Attività produttive, audizioni su riscossione oneri generali sistema elettrico – Mercoledì dalle 14,30 diretta webtv

Mercoledì 21 novembre, la Commissione Attività produttive, nell’ambito della discussione della risoluzione recante iniziative urgenti in materia di riscossione degli oneri generali del sistema elettrico, svolge le seguenti audizioni:
ore 14.30 audizione di rappresentanti di Acquirente unico;
ore 15.00 audizione di rappresentanti di Associazioni dei consumatori.
L’appuntamento viene trasmesso in diretta webtv.

Tratto da: www.camera.it
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Commissione Esteri, audizione Giovannini, portavoce ASviS – Mercoledì alle 14 diretta webtv

Mercoledì 21 novembre, alle ore 14, la Commissione Esteri, nell’ambito dell’indagine conoscitiva sull’azione internazionale dell’Italia per l’attuazione dell’Agenda 2030 per lo sviluppo sostenibile, svolge l’audizione del professor Enrico Giovannini, portavoce dell’Alleanza Italiana per lo Sviluppo Sostenibile (ASviS).
L’appuntamento viene trasmesso in diretta webtv.

Tratto da: www.camera.it
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Ferocia – Fateci smettere questo spettacolo! – Rappresentazione contro la violenza sulle donne – Partecipa Spadoni – Giovedì alle 11 diretta webtv

In occasione della Giornata internazionale per l’eliminazione della violenza contro le donne, la Vicepresidente della Camera, Maria Edera Spadoni, promuove la rappresentazione teatrale “Ferocia – Fateci smettere questo spettacolo!”, di Betta Cianchini, con la presenza di studenti di istituti romani, invitati dal Miur. Seguono le letture di testimonianze raccolte per le strade di Roma e provincia dalla stessa autrice. L’appuntamento – trasmesso in diretta webtv – si svolge giovedì 22 novembre (altro…)

Presidente Alberti Casellati a Londra: incontro con gli Speaker della Camera dei Comuni e della Camera dei Lords

Martedì 20 11 2018

Visita ufficiale a Londra del Presidente del Senato. Oggi, dopo un breve passaggio alla National Gallery per rendere omaggio alla mostra Mantegna e Bellini, è previsto un duplice incontro a Westminster: con lo Speaker della Camera dei Comuni, Rt Hon John Bercow, e con lo Speaker della Camera dei Lords, Baron Norman Fowler. A seguire, la colazione offerta dallo Speaker della House of Lords completa la prima (altro…)

Disposizioni urgenti in materia di immigrazione e sicurezza

E’ all’esame della Camera il decreto-legge 113/2018, approvato con modificazioni dal Senato, che reca disposizioni urgenti riconducibili principalmente a due settori di intervento: protezione umanitaria, protezione internazionale e immigrazione, da un lato, e sicurezza pubblica dall’altro.

Tratto da: www.camera.it
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Disposizioni urgenti in materia di immigrazione e sicurezza

E’ all’esame della Camera il decreto-legge 113/2018, approvato con modificazioni dal Senato, che reca disposizioni urgenti riconducibili principalmente a due settori di intervento: protezione umanitaria, protezione internazionale e immigrazione, da un lato, e sicurezza pubblica dall’altro.

Tratto da: www.camera.it
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Esame delle norme sui reati contro la pubblica amministrazione

Oggi in Aula la discussione (previo esame e votazione delle questioni pregiudiziali di costituzionalità presentate) del disegno di legge: Misure per il contrasto dei reati contro la pubblica amministrazione e in materia di trasparenza dei partiti e movimenti politici (ai sensi dell’articolo 69, comma 1, del Regolamento) (C. 1189-765-A).

A seguire l’esame della proposta di legge: Modifica all’articolo 12 del codice della strada, di cui al decreto legislativo 30 aprile 1992, n. (altro…)

Modelling the cost-effectiveness of a rapid diagnostic test (IgMFA) for uncomplicated typhoid fever in Cambodia

by Mari Kajiwara Saito, Christopher M. Parry, Shunmay Yeung

Typhoid fever is a common cause of fever in Cambodian children but diagnosis and treatment are usually presumptive owing to the lack of quick and accurate tests at an initial consultation. This study aimed to evaluate the cost-effectiveness of using a rapid diagnostic test (RDT) for typhoid fever diagnosis, an immunoglobulin M lateral flow assay (IgMFA), in a remote health centre setting in (altro…)

Vertical transmission of naturally occurring Bunyamwera and insect-specific flavivirus infections in mosquitoes from islands and mainland shores of Lakes Victoria and Baringo in Kenya

by Yvonne Ukamaka Ajamma, Thomas Ogao Onchuru, Daniel O. Ouso, David Omondi, Daniel K. Masiga, Jandouwe Villinger

Background

Many arboviruses transmitted by mosquitoes have been implicated as causative agents of both human and animal illnesses in East Africa. Although epidemics of arboviral emerging infectious diseases have risen in frequency in recent years, the extent to which mosquitoes maintain pathogens in circulation during inter-epidemic periods is still poorly understood. This study aimed to (altro…)

Antivirus effectiveness of ivermectin on dengue virus type 2 in <i>Aedes albopictus</i>

by Tie-Long Xu, Yin Han, Wei Liu, Xing-Ya Pang, Bin Zheng, Yi Zhang, Xiao-Nong Zhou

Background

Dengue fever is the most rapidly spreading mosquito-borne viral disease over the past 50 years, with a 30-fold increase in global incidence. Dengue vector control is a key component for the dengue control strategy, since no absolutely effective vaccine or drug is available yet. However, the rapid rise and spread of mosquito insecticide resistance have become (altro…)

CYP-mediated permethrin resistance in <i>Aedes aegypti</i> and evidence for <i>trans</i>-regulation

by Letícia B. Smith, Rakshit Tyagi, Shinji Kasai, Jeffrey G. Scott

Aedes aegypti poses a serious risk to human health due to its wide global distribution, high vector competence for several arboviruses, frequent human biting, and ability to thrive in urban environments. Pyrethroid insecticides remain the primary means of controlling adult A. aegypti populations during disease outbreaks. As a result of decades of use, pyrethroid resistance is a global problem. Cytochrome P450 (altro…)

RNA virus evasion of nonsense-mediated decay

by Jared P. May, Xuefeng Yuan, Erika Sawicki, Anne E. Simon

Nonsense-mediated decay (NMD) is a host RNA control pathway that removes aberrant transcripts with long 3’ untranslated regions (UTRs) due to premature termination codons (PTCs) that arise through mutation or defective splicing. To maximize coding potential, RNA viruses often contain internally located stop codons that should also be prime targets for NMD. Using an agroinfiltration-based NMD assay in Nicotiana benthamiana, we (altro…)

Macrophage activation by IFN-γ triggers restriction of phagosomal copper from intracellular pathogens

by Qian Shen, Matthew J. Beucler, Stephanie C. Ray, Chad A. Rappleye

Copper toxicity and copper limitation can both be effective host defense mechanisms against pathogens. Tolerance of high copper by fungi makes toxicity as a defense mechanism largely ineffective against fungal pathogens. A forward genetic screen for Histoplasma capsulatum mutant yeasts unable to replicate within macrophages showed the Ctr3 copper transporter is required for intramacrophage proliferation. Ctr3 mediates copper uptake and (altro…)

We are not Charlie and we will never be.